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Représentation de protéines par la sonification d’objets 3D
Auteur : Valère Raigneau
Directeur(s) de mémoire : Alan Blum & Tifanie Bouchara
Son
RĂ©sumĂ© : Ce mĂ©moire propose une entrĂ©e approfondie dans le domaine de la sonification de donnĂ©es, une jeune discipline dont le dĂ©veloppement s’est particulièrement accru au cours des vingt dernières annĂ©es. Notre travail de recherche s’inscrit spĂ©cifiquement au sein du projet VIDOCK, qui cherche Ă proposer aux biologistes plusieurs niveaux de reprĂ©sentation de protĂ©ines. Ă€ terme, l’objectif est de pouvoir identifier des similaritĂ©s ou au contraire des singularitĂ©s locales sur et entre diffĂ©rentes macromolĂ©cules. Le projet se consacre donc en particulier Ă la reprĂ©sentation visuelle de la surface des protĂ©ines en trois dimensions. Or, il a Ă©tĂ© montrĂ© que l’utilisation de la sonification permettait notamment de renforcer les reprĂ©sentations visuelles. Nous avons donc vu dans ce projet l’opportunitĂ© de mettre Ă profit les apports de la modalitĂ© auditive. Nous dĂ©taillons ainsi dans le prĂ©sent manuscrit la conception et l’intĂ©gration de notre reprĂ©sentation sonore de protĂ©ines par la sonification d’objets 3D.
Mots-clés : Sonification de données, Interface sonore, Modalité auditive, Spatialisation, Visualisation, Protéine, Objet 3D, Surface, Forme.
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Abstract: This thesis proposes a deep insight into data sonification – a discipline that has gained significant interest over the last few years. Our work is conducted within the VIDOCK project which intends to propose to biologists several levels of displaying proteins. The long-term objective of this project is to identify local similarities or dissimilarities within and between various proteins. Accordingly, it focuses on visual representation of surface in three dimensions. However, it has been shown that having an auditory modality input would enhance visual display. It is why we see an opportunity in using sonification for this project. Therefore, we present in this manuscript the theoretical and practical conception of our own strategy of sonification of proteins as 3D objects.
Keywords: Sonification, Auditory display, Auditory modality, Spatialization, Visualization, Protein, 3D objet, Surface, Shape.